Usos y ejemplos de SystemModeler

Glucólisis: Estudie las oscilaciones en células de levadura

Las oscilaciones glicolíticas en células de levadura de la especie Saccharomyces cerevisiae son un fenómeno bien estudiado. En este ejemplo se simulan las oscilaciones cerca de una bifurcación llamada Hopf. Cambie un parámetro ligeramente alrededor del punto de bifurcación cambia cualitativamente el comportamiento del sistema.

Para ejecutar este ejemplo, usted necesitará

SystemModeler 3.

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Importe Modelos SBML

Importe fácilmente el modelo al formato Systems Biology Markup Language (SBML).

Realice Simulaciones de Diferentes Escenarios

Compare cómo pequeños cambios en el parámetro de bifurcación afectan las oscilaciones de las concentraciones de proteína y la molécula.

         
 
Modelo de ejemplo de BioChem
para la glucólisis de levadura
Componente citosol
Oscilaciones ATP en diferentes
partes del punto de bifurcación
 
   
   
         
Visualice Redes de Reacciones Biológicas

Utilice la biblioteca incorporada BioChem para visualizar y simular el modelo.

 
Hynne et al., 2001. Modelo a escala completa de la glucólisis en Saccharomyces cerevisiae.
Biophys Chem. 94(1–2):121–63.
 


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