Moléculas representadas por cadeias SMILES
Cadeias SMILES são uma maneira compacta de representar uma molécula, em vez de usar nomes químicos sistemáticos. A notação permite gerar de maneira rápida e fácil novas estruturas químicas.
A unidade básica de uma cadeia SMILES é o símbolo atômico contido entre colchetes. Por exemplo, "[Xe]" representa um átomo de 
livre.
Dois símbolos atômicos juntos sem nada entre eles representam uma único ligação.
Valores de carga ou isótopos podem ser incluídos no símbolo do átomo.
Para os elementos orgânicos comuns, não é necessário adicionar parênteses em torno do símbolo atômico, e átomos de hidrogênio são adicionados para preencher a valência atômica normal. Portanto, o metano é representado simplesmente como "C".
Quando convertidos a uma Molecule, os hidrogênios são adicionados automaticamente.
Para fazer uma cadeia linear de átomos conectada por ligações simples, basta combinar seus símbolos em ordem.
Ligações duplas e triplas são indicadas com "=" e "#" símbolos, respectivamente, e anéis são indicados pela adição de uma legenda numérica a dois átomos adjacentes.
A ilustração abaixo mostra uma cadeia linear e uma variante de anel. A única diferença na notação é marcar o primeiro e último átomos com o mesmo número.
