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Análisis de la distribución de mutaciones

Veamos la distribución de las diferencias genéticas para algunos polimorfismos de un solo nucleótido (SNP, por su sigla en inglés) elegidos al azar. Un SNP es un tipo particular de variación genética, donde una base del nucleótido se sustituye por otra en una sola posición de la secuencia del gen.

Primero, elegimos aleatoriamente los SNP que analizaremos.

A continuación, recopilamos la frecuencia de cada base que ocurre en el mismo cambio y las clasificamos de acuerdo la frecuencia en porcentaje, mostrando solo los cinco cambios más frecuentes.

Dividamos estos datos en grupos de acuerdo a las bases afectadas en los cambios.

Ahora podemos graficar la probabilidad de que al cambiar cada base, se otorgue la base más común.

Aquí podemos ver cual es la probabilidad de que los cambios de bases que elegimos no tengan una distribución uniforme.

Podemos encontrar cuánto varía la presencia de una base dada según como varíe la base típica.

También podemos determinar la probabilidad de que una base dada este presente en cada SNP.

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