突然変異の分布を解析する
ランダムに選ばれた単一ヌクレオチド多型(SNP)の遺伝的差異の分布を見てみる．SNPは遺伝子変異の一種であり，一つのヌクレオチド塩基が遺伝子配列の1ヶ所で別のものに置換されている．
まず考えるSNPをランダムに選ぶ．
次に同じ変異で発生する各塩基の頻度を集め，頻度百分率で並べ替え，最も頻度の高い5つの変異を表示する．
変異で影響を受けた塩基によって，データをグループ分けする．
より一般的な塩基を与えられたときに，これらの塩基のそれぞれの変異がどの程度起こるかをプロットすることができる．
選ばれた変異の尤度が一様分布とどの程度異なるかを見ることができる．
指定された対立遺伝子が，通常の塩基あるいは突然変異としてどの程度存在するかを求めることができる．
塩基が存在する場合に，各SNPの特定の塩基の平均尤度を求めることもできる．
