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Analise a distribuição de mutações

Veja a distribuição das diferenças genéticas para alguns polimorfismos de nucleotídeo único (em inglês single nucleotide polymorphism; SNP) escolhidos aleatoriamente. Um SNP é um tipo particular de variação genética em que uma base de nucleotídeo é substituída por outra em uma única posição na sequência do gene.

Primeiro, escolha aleatoriamente os SNPs a serem analisados.

Em seguida, reúna a frequência de cada base que ocorre na mesma alteração e ordene-as pela porcentagem de frequência, mostrando as cinco alterações mais frequentes.

Divida esses dados em grupos pelas bases afetadas nas alterações.

Agora podemos fazer um gráfico da probabilidade de cada alteração de cada base, considerando a base mais comum.

Aqui podemos ver como a probabilidade de cada base nas alterações escolhidas difere de ser uniformemente distribuída.

Podemos descobrir a variação da presença de um determinado alelo, como base típica ou mutação.

Podemos também determinar a probabilidade média de qualquer base específica em cada posição do SNP, considerando que a base esteja presente.

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