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Conecte-se a uma instância pública do MySQL

Na bioinformática, há vários terminais SQL públicos que contêm conjuntos de dados muito grandes. Este exemplo mostra como é fácil se conectar a um e extrair rapidamente informações que seriam muito difíceis de processar na memória.

Para ver alguns dados, você precisa se conectar ao terminal público fornecido pelo projeto ensembl e extrair informações do esquema para duas tabelas.

Construa um EntityStore.

Em seguida você pode registrá-lo.

Como você está descarregando o cálculo para o banco de dados externo, tudo é muito rápido.

Existem mais de 2,5 milhões de linhas na tabela e você pode contá-las em uma fração de segundo (incluindo a latência da rede).

Uma questão interessante é: Quais são os biótipos mais comuns para genes? Primeiro você vai agrupar por biótipo e contar os genes.

Em seguida, classifique pela propriedade "count" e considere apenas as 10 maiores.

Note que as duas últimas operações são puramente simbólicas. Para executar a consulta, chame EntityValue.

Faça um gráfico dos dados.

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