Conéctese a una instancia pública de tipo MySQL

En bio-informática existen varios puntos finales públicos SQL que contienen grandes bases de datos. Este ejemplo muestra lo sencillo que es conectarse a uno y rápidamente extraer información que sería difícil procesar en la memoria.

Con tal de ver algunos datos, es necesario conectarse a un punto final público proporcionado por el proyecto ensembl y extraer la información del para las dos tablas.

Construya una EntityStore.

Luego puede registrarla.

Dado que está descargando el cálculo a la base de datos

externa, todo es más rápido.

Existen más de 2.5 millones de filas en una tabla y usted ha podido contarlas en una fracción de segundo (incluyendo una red de ida y vuelta).

Una pregunta interesante es, ¿cuáles son los biotipos más comunes de genes? Primero, agrupe por biotipo y cuente los genes.

Luego ordene por la propiedad "count" y tome solamente los 10 más grandes.

Note que las dos últimas operaciones son puramente simbólicas. Para ejecutar la consulta llame a EntityValue.

Grafique los datos.