Conéctese a una instancia pública de tipo MySQL
En bio-informática existen varios puntos finales públicos SQL que contienen grandes bases de datos. Este ejemplo muestra lo sencillo que es conectarse a uno y rápidamente extraer información que sería difícil procesar en la memoria.
Con tal de ver algunos datos, es necesario conectarse a un punto final público proporcionado por el proyecto ensembl y extraer la información del para las dos tablas.
Construya una EntityStore.
Luego puede registrarla.
Dado que está descargando el cálculo a la base de datos
externa, todo es más rápido.
Existen más de 2.5 millones de filas en una tabla y usted ha podido contarlas en una fracción de segundo (incluyendo una red de ida y vuelta).
Una pregunta interesante es, ¿cuáles son los biotipos más comunes de genes? Primero, agrupe por biotipo y cuente los genes.
Luego ordene por la propiedad "count" y tome solamente los 10 más grandes.
Note que las dos últimas operaciones son puramente simbólicas. Para ejecutar la consulta llame a EntityValue.
Grafique los datos.
