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세포 형태에 따라 분류하기

이 예는 세포 분할 및 분석하여 세포의 쌍 또는 셀 클러스터에서 단순 세포를 분류하는 방법을 보여줍니다. ComponentMeasurements의 새로운 윤곽 특성을 사용하면 윤곽선이 세포를 둘러싼 볼록 껍질과 비교됩니다. 이 비교에서 세포 유형의 분류에 사용되는 볼록 결함을 표시할 수 있습니다.

Image from Liu, Y., Aubrey, W., Martin, K., Sparkes, A., Lu, C. and King, R.D., 2011. The analysis of yeast cell morphology features in exponential and stationary Phase. Journal of Biological Systems, 19(04), pp. 561575.

세분화 마스크를 계산하고 이를 사용하여 윤곽을 측정합니다.

작은 유틸리티를 구축하여 윤곽의 ConvexHullMesh를 얻고 결함을 계산합니다. PeakDetect를 사용하면 두 세포 사이의 접촉점을 찾을 수 있습니다.

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윤곽의 볼록 결함 및 FindPeaks를 사용하여 분엽된 세포의 파인더를 구축할 수 있습니다.

마지막으로 볼록한 결함에 기초한 세포 형태 분류기를 가져옵니다. 이는 세포가 단순형 세포(결함이 없거나 하나)인지 셀의 쌍(결함이 두개)인지 복잡형 세포(여러 결함)인지를 분류합니다.

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