현미경의 메타 데이터 가져와서 사용하기
모달리티, 기록 장치, 노출 시간 등, 이미지에 대한 추가 정보는, 일반적으로 이미지 파일의 메타 데이터에 저장됩니다. BioFormatsLink는 이미지 데이터 및 메타 데이터를 Wolfram 언어로 가져오기 위해 Bio-Formats 라이브러리와 상호 작용하는 패키지입니다.
파리 파스퇴르 연구소의 PFID Imagopôle의 Jean-Yves Tinevez가 제공한 쥐의 신장 절편의 Zip 압축된 Leica LIF 파일을 다운로드하여 압축을 풉니다.
첫 번째 이미지 라인을 3D 입체로 가져옵니다.
이미지를 포개어 관찰합니다.
메타 정보를 규칙 목록으로 추출합니다.
OME 메타 정보를 XML 구조로 가져옵니다.
첫 번째 이미지 라인의 복셀 관련 정보를 대체 규칙 목록으로 추출합니다.
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방향의 복셀 크기, 수량 목록으로 작성합니다.
최초의 이미지 라인은 유도 방출 억제 현미경법(STED)으로 얻은 것입니다. 여기서는 이 모달리티에 사용된 레이저 파장이 추출됩니다.
적용된 레이저 파장의 목록을 작성합니다.
이외에도 현미경과 필터의 지정, 취득 날짜, 데이터, 채널 코딩 등 다양한 정보를 얻을 수 있습니다.
