Classifique as células com base em seu formato
Este exemplo demonstra como segmentar e analisar células para classificar células simples de pares ou aglomerados de células. As novas propriedades de contorno em ComponentMeasurements são usados e o contorno é comparado com o casco convexo ao redor das células. Essa comparação pode mostrar defeitos de convexidade usados para classificação de tipos de células.
Imagem de Liu, Y., Aubrey, W., Martin, K., Sparkes, A., Lu, C. and King, R.D., 2011. A análise das características da morfologia celular da levedura na fase exponencial e estacionária. Journal of Biological Systems, 19(04), pp. 561–575.
Calcule uma máscara de segmentação e use-a para medir os contornos.
Construa um pequeno utilitário para obter o ConvexHullMesh dos contornos e calcular os defeitos. Com PeakDetect, você também pode encontrar os pontos de junção entre duas células.
Agora é possível construir o localizador de células lobadas usando defeitos de convexidade de contorno e FindPeaks.
Finalmente, você obtém o classificador de formato de célula com base nos defeitos de convexidade, que informa se a célula é simples (nenhum defeito ou um), um par de células (dois defeitos) ou complexa (vários defeitos).
