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Segmentación y captación fluorescente de células

Este ejemplo demuestra cómo segmentar una imagen de células cerebrales de rata teñidas e identificar y contar células con captación de marcadores fluorescentes.

Las células cerebrales de rata teñidas son visibles en el canal azul de la imagen .

El marcador fluorescente se exhibe en el canal verde.

Regularizar la imagen celular con un filtro bilateral.

Extraiga una máscara de fondo con umbral de histéresis.

Busque un punto de semilla para cada célula buscando máximos en una escala dada .

Obtenga una segmentación celular a través del algoritmo de cuenca hidrográfica.

Mida la cantidad de fluorescencia en cada segmento celular.

Visualice todas las células con más de una cierta absorción fluorescente.

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