Clasificación de células en función de su forma
Este ejemplo demuestra cómo segmentar y analizar células para clasificar las células simples de los pares o grupos de células. Se utilizan nuevas propiedades de contorno en ComponentMeasurements, y el contorno se compara con el casco convexo alrededor de las células. Esta comparación puede mostrar defectos de convexidad utilizados para la clasificación de los tipos de células.
Imagen de Liu, Y., Aubrey, W., Martin, K., Sparkes, A., Lu, C. y King, R.D., 2011. El análisis de las características de la morfología de las células de levadura en fase exponencial y estacionaria. Journal of Biological Systems, 19 (04), págs. 561-575.
Calcule una máscara de segmentación y úsela para medir los contornos.
Cree una pequeña utilidad para obtener la ConvexHullMesh de los contornos y calcular los defectos. Con PeakDetect, También puede encontrar los puntos de unión entre dos células.
Ahora es posible construir el buscador de células lobuladas usando defectos de convexidad de contorno y FindPeaks.
Finalmente, obtenga el clasificador de forma de célula basado en defectos de convexidad, que informa si la célula es simple (sin o con un defecto), un par de células (dos defectos) o compleja (defectos múltiples).
