Génération de coordonnées atomiques
Wolfram Language est capable de générer des structures 3D pour des molécules basées uniquement sur le graphe chimique. Cet exemple illustre comment générer 100 conformations aléatoires pour l'adénosine et déterminer la structure la plus basse en énergie.
Générez une liste de 100 molécules avec différentes coordonnées générées au hasard.
Visualisez les molécules qui sont entassées le plus près possible les unes des autres.
Déterminez l'énergie du champ de force pour les différentes conformations.
Optimisez maintenant les conformations énergétiques en utilisant le champ de force MMFF. Remarquez que l'écart d'énergie est plus faible et que l'énergie globale a diminué.
Utilisez TakeSmallestBy pour rechercher la molécule ayant la conformation la plus basse en énergie.
