Mikroskop-Metadaten importieren und verwenden
Metainformationen zu Bildern wie die Modalität, das Aufnahmegerät, die Belichtungszeit usw. werden in der Regel in den Metadaten einer Bilddatei gespeichert. BioFormatsLink ist ein Paket zur Interaktion mit der BioFormats-Bibliothek, um Bilddaten und Metadaten in die Wolfram Language zu importieren.
Laden Sie eine ZIP-archivierte Leica LIF-Datei eines Nierenquerschnitts einer Maus, die von Jean-Yves Tinevez de PFID Imagopôle am Pariser Institut Pasteur bereitgestellt wurde, herunter und entpacken Sie diese.
Importieren Sie die erste Bildserie als 3D-Volumen.
Sehen Sie sich die Bilder an.
Extrahieren Sie die einfache Metainformation als Regelliste.
Importieren Sie die OME-Metainformationen als XML-Struktur.
Extrahieren Sie voxelbezogene Informationen der ersten Bildserie als Liste von Ersetzungsregeln.
Ermitteln Sie die Voxelgröße in den Dimensionen 
, 
und 
als eine Liste der Größe.
Die erste Bildserie wurde durch Stimulated Emission Depletion (STED) aufgenommen. Hier werden die in dieser Modalität verwendeten Laserwellenlängen extrahiert.
Erstellen Sie die Liste der Wellenlängen der eingesetzten Laser.
Es können noch weitere Informationen extrahiert werden, z.B. Mikroskop- und Filterspezifikationen, Erfassungsdaten, Daten- und Kanalcodierungen, etc.
