Generación de coordenadas atómicas
Wolfram Language puede generar estructuras en 3D de moléculas basadas solo en el grafo químico. Este ejemplo muestra cómo generar 100 conformaciones aleatorias para la adenosina y encontrar la estructura de menor energía.
Genere una lista de 100 moléculas con diferentes coordenadas generadas aleatoriamente.
Visualice las moléculas agrupadas lo más cerca posible.
Encuentre la energía del campo de fuerza para las diferentes conformaciones.
Ahora optimice las conformaciones de energía utilizando el campo de fuerza MMFF. Note que la distribución de energía es menor y el total de energías ha disminuido.
Use TakeSmallestBy para encontrar la molécula con la conformación de menor energía.
