Moléculas de cadenas SMILES
Las cadenas SMILES son una forma compacta de representar a una molécula en lugar de usar nombres químicos sistemáticos. La notación permite generar nuevas estructuras químicas rápida y fácilmente.
La unidad básica de una cadena SMILES es el símbolo atómico entre corchetes. Por ejemplo, "[Xe]" representa un átomo de
libre.Dos símbolos atómicos juntos, sin nada entre ellos, representan un enlace simple.
Los valores de carga o isótopos pueden incluirse dentro del símbolo átomico.
No es necesario agregar corchetes alrededor del símbolo atómico para los elementos orgánicos comunes, y se agregan átomos de hidrógeno para completar la valencia atómica normal. Por lo tanto, el metano se representa simplemente como "C".
Cuando se convierten a Molecule, los hidrógenos se agregan automáticamente.
Para hacer una cadena lineal de átomos conectados por enlaces simples, simplemente combine sus símbolos en orden.
Los enlaces dobles y triples se indican con los símbolos "=" y "#" respectivamente, y los anillos son indicados mediante la adición de una etiqueta numérica a dos átomos adyacentes.
El siguiente ejemplo ilustra una cadena lineal y una variante de anillo. La única diferencia de notación es marcar el primer y el último átomo con el mismo número.
