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タンパク質の構造の複雑性を解き明かす

この例では、タンパク質の構造の複雑性がその機能によってどのように異なるかを比較する.構造の複雑性を評価するために,二次構造(ヘリックスやシート等)の特徴の数を使う.タンパク質についての情報は"Protein"実体タイプから入手できる.

3つのタンパク質のサンプル.

二次構造と分子機能を得るためにタンパク質の実体を集める.

それぞれのタンパク質について,二次構造の数を数える.

各タンパク質の分子機能と特徴数を使って,各機能に対する特徴数を得ることができる.特徴の数はタンパク質によって大きく異なることがあるため,以下では構造数の中央値を使う.

機能に対する特徴の中央値により,逆引きを使ってその中央値の特徴を持つ各機能に対するタンパク質を見付けることができる.

さまざまな構造的複雑性を表示するために,可能な場合は,各機能の例となる中央値のタンパク質のリボン図を求める.

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