Analyse de coordonnées internes
Les coordonnées moléculaires internes sont des ensembles de longueurs de liaison, d'angles de liaison et d'angles de torsion qui définissent complètement une structure 3D. Les coordonnées internes sont utilisées dans une variété d'applications chimiques et d'études de propriétés.
Explorez les longueurs de liaison et les angles de torsion présents dans le maltose diholoside.
Utilisez MoleculeValue pour rechercher toutes les longueurs de liaison. La liste des longueurs de liaison est renvoyée en utilisant la structure efficace QuantityArray.
Utilisez MeanAround pour rechercher la longueur moyenne des liaisons.
Utilisez BondList pour extraire les atomes et les longueurs de chaque liaison, puis regroupez les longueurs de liaison par les atomes qui la composent.
Déterminez la longueur moyenne des liaisons pour chaque type de liaison.
La recherche d'angles de liaison est plus complexe si chaque angle comporte deux liaisons. Tout d'abord, définissez un schéma représentant trois atomes liés séquentiellement.
Utilisez FindMoleculeSubstructure pour rechercher les indices des atomes correspondant à ce schéma.
Pour regrouper les angles de liaison par type d'atome, définissez une fonction de tri pour vous assurer que les angles CCH et HCC sont regroupés.
Regroupez les positions des angles en utilisant la fonction "angleLabel".
Visualisez la variance pour différents types d'angles de liaison dans cette molécule.
