Análisis de coordenadas internas
Las coordenadas moleculares internas son conjuntos de longitudes y ángulos de enlace y ángulos de torsión que definen completamente una estructura 3D. Las coordenadas internas se usan en una variedad de aplicaciones químicas y en la investigación de propiedades.
Explore las longitudes de enlaces y los ángulos de torsión presentes en el disacárido maltosa.
Use MoleculeValue para encontrar todas las longitudes de enlaces. La lista de longitudes de enlace se devuelve utilizando la estructura eficiente QuantityArray.
Use MeanAround para encontrar la longitud de enlace promedio.
Use BondList para extraer los átomos y las longitudes de cada enlace, luego agrupe las longitudes de los enlaces de acuerdo a los átomos miembro.
Encuentre la longitud de enlace promedio para cada tipo de enlace.
Es más difícil encontrar los ángulos de enlace si cada ángulo involucra dos enlaces. Primero, defina un patrón que represente a tres átomos unidos secuencialmente.
Use FindMoleculeSubstructure para encontrar los índices de los átomos que coincidan con este patrón.
Para agrupar los ángulos de enlace por tipo de átomo, defina una función de clasificación para asegurarse de que los ángulos CCH y HCC estén agrupados.
Agrupe las posiciones de los ángulos usando la función angleLabel.
Visualice la varianza para diferentes tipos de ángulos de enlace en esta molécula.
