Wolfram 语言™

生成原子坐标

Wolfram 语言能够仅根据化学图生成分子的 3D 结构。下面的例子显示如何为腺苷生成 100 个随机构象并找到能量最低的结构。

生成 100 个具有不同随机坐标的分子的列表。

可视化分子尽可能紧密地排列在一起的情形。

求不同构象的力场能。

现在使用 MMFF 力场优化能量构象。注意，能量散布变小，总能量减少。

用 TakeSmallestBy 找出能量构象最低的分子。