分子形状分析 (MSA) 是进行许多定量构效关系 (QSAR) 研究非常重要的第一步。下面的例子说明了如何使用主惯性矩 (PMI) 对分子形状进行分类，以及如何使用 PMI 图对形状进行可视化。
考虑三种不同形状的分子。
计算分子的 3D 坐标并求主惯性矩。
用两个较小的惯性矩除以最大的惯性矩，对主惯性矩进行归一化。
用主惯性矩的比值作为坐标，形成了一个三角形。
比较一组分子的形状，用主惯性矩的比值作为坐标，用三维绘图作为提示条。
