부탄의 비틀림 위치 에너지 표면
Wolfram 언어는 MMFF94의 역장 구현을 도입 하였습니다. 이는 모든 자동 생성된 좌표에 대한 에너지를 최소화하기 위해 사용됩니다. 원자 사이의 거리 혹은 각도 등의 원하는 내부 좌표를 가진 형태를 구하기 위해 내장된 역장에 제약 조건을 간단히 추가할 수 있습니다.
아래의 예는 중앙의 탄소와 탄소의 결합 주위의 비틀림 각을 체계적으로 변경하여 부탄의 구조적 에너지를 조사함과 동시에 일차원의 위치 에너지 표면을 생성합니다.
부탄의 분자를 생성합니다.
원자 C1-C2-C3-C4의 비틀림 각은 원자 C1-C2-C3을 포함하는 평면과 원자 C2-C3-C4를 포함하는 평면 사이의 각입니다. 이러한 평면을 부탄의 공 막대기 모델과 함께 시각화합니다.
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MoleculeModify를 사용하여 비틀림 각을 변경시켜 각 단계의 결과를 표에 남깁니다.
에너지 및 비틀림 각의 관계를 플롯합니다.
일반적으로 각각 "synperiplanar", "antiperiplanar"로 불리는 최소와 최대의 에너지 형태를 찾습니다.
