Energía potencial torsional de la superficie del butano
Wolfram Language incluye la implementación del campo de fuerza MMFF94, que se utiliza para minimizar la energía de todas las coordenadas generadas automáticamente. Para encontrar una conformación con una coordenada interna deseada, como por ejemplo una distancia o ángulo interatómico, es fácil agregar una restricción al campo de fuerza integrado.
Este ejemplo explora la energía conformacional del butano variando sistemáticamente el ángulo de torsión alrededor del enlace carbono-carbono central, generando una superficie de energía potencial unidimensional a lo largo del proceso.
Cree una molecula para el butano.
El ángulo de torsión para los átomos C1-C2-C3-C4 es el ángulo entre el plano que contiene los átomos C1-C2-C3 y el plano que contiene los átomos C2-C3-C4. Visualice estos planos junto con el modelo de barras y esferas del butano.
Use MoleculeModify para variar el ángulo de torsión, manteniendo el resultado de cada paso en una tabla.
Grafique la energía contra el ángulo de torsión.
Encuentre las conformaciones de energía más bajas y más altas, a las que se les suele llamar "sinperiplanar" y "antiperiplanar".
