Die Verteilung von Mutationen analysieren
Betrachten Sie die Verteilung der genetischen Unterschiede für einige zufällig ausgewählte Einzelnukleotid-Polymorphismen (SNP, Single Nucleotide Polymorphism). Ein SNP ist eine Variation eines einzelnen Basenpaares in einem komplementären DNA-Doppelstrang.
Wählen Sie zunächst zufällige SNPs aus.
Als nächstes sammeln Sie die Häufigkeit jeder Base, die in der gleichen Änderung auftritt, und sortieren Sie sie nach dem Prozentsatz ihrer Häufigkeit, wobei Sie die fünf häufigsten Änderungen sehen.
Unterteilen Sie diese Daten in Gruppen nach den von den Änderungen betroffenen Basen.
Sie können nun grafisch darstellen, wie wahrscheinlich jede Änderung jeder Base ist, wenn man die häufiger vorkommende Base betrachtet.
Hier sehen Sie, wie sich die Wahrscheinlichkeit jeder Base in den gewählten Änderungen von der gleichmäßigen Verteilung unterscheidet.
Sie können feststellen, wie sehr das Vorhandensein eines bestimmten Allels als typische Base oder Mutation variiert.
Sie können auch die mittlere Wahrscheinlichkeit einer bestimmten Base an jedem SNP-Standort bestimmen, sofern die Base vorhanden ist.
