解糖：酵母細胞の振動の研究

酵母細胞の一種である「サッカロミセスセレビシエ」の解糖振動は，よく研究されている現象です．この例ではホップ分岐付近での振動のシミュレーションを行います．分岐点付近でわずかにパラメータを変更すると，系の挙動が定性的に変化します．

SBMLモデルのインポート

Sytems Biology Markup Language (SBML)形式で簡単にモデルをインポートします．

さまざまな状況のシミュレーション

分岐パラメータのわずかな変化が，タンパク質の振動と分子の濃度にどの程度の影響を与えるかを比較します．

酵母解糖の
BioChem例題モデル

細胞質基質の成分

分岐点の両側での
ATP振動

生体反応ネットワークを可視化

組込みのBioChemライブラリを使って，モデルを可視化しシミュレーションを行ないます．

Hynne et al., 2001. Full-scale model of glycolysis in Saccharomyces cerevisiae.
Biophys Chem. 94(1–2):121–63.

Wolfram System Modeler