Wolfram 语言

导入并使用显微镜元数据

图像元信息(如模态、记录设备、曝光时间等)通常存储在图像文件的元数据中。BioFormatsLink 是一个用来与 Bio-Formats 库交互的软件包,可用于将图像数据和元数据导入 Wolfram 语言。

下载并解压缩由巴黎 Institut Pasteur 的 PFID Imagopôle 部门的 Jean-Yves Tinevez 提供的 ZIP 格式的小鼠肾脏切片 Leica LIF 文件。

将第一个系列图像导入为 3D 形体。

查看图像。

以一组规则的形式提取元信息。

将 OME 元信息导入为 XML 结构。

以替换规则的形式提取第一个图像系列与体素相关的信息。

用一组量构建体素在 方向上的大小。

第一个图像系列是通过受激发射损耗显微镜 (STED) 获得的。下面提取在该模态中使用的激光的波长。

构建应用的激光的波长列表。

还可以提取更多信息,如显微镜和滤波器的规格、采集日期、数据和通道编码等。

相关范例

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