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Segmentation et absorption fluorescente des cellules

Cet exemple illustre comment segmenter une image de cellules cérébrales de rat et comment identifier et compter les cellules à l'aide de marqueurs fluorescents.

Des cellules cérébrales de rat sont visibles dans le canal bleu de l'image.

Le marqueur fluorescent est affiché dans le canal vert.

Régularisez l'image de la cellule avec un filtre bilatéral.

Extrayez un masque de fond avec un seuil d'hystérésis.

Recherchez un point de départ pour chaque cellule en recherchant des maxima à une échelle donnée.

Créez une segmentation cellulaire via l'algorithme de la ligne de partage des eaux.

Mesurez la quantité de fluorescence dans chaque segment cellulaire.

Visualisez toutes les cellules avec une absorption fluorescente supérieure à un certain seuil.

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