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Moleküle aus SMILES-Strings

SMILES-Strings sind eine kompakte Möglichkeit, ein Molekül darzustellen, anstatt systematische chemische Namen zu verwenden. Die Notation ermöglicht es Ihnen, schnell und einfach neue chemische Strukturen zu erzeugen.

Die Grundeinheit einer SMILES-Zeichenkette ist das in Klammern eingeschlossene Atomsymbol. So steht beispielsweise "[Xe]" für ein freies Atom.

Zwei atomare Symbole zusammen mit nichts dazwischen stellen eine Einfachbindung dar.

Ladungs- oder Isotopenwerte können im Atomsymbol enthalten sein.

Für die üblichen organischen Elemente ist es nicht notwendig, Klammern um das atomare Symbol herum anzubringen, und Wasserstoffatome werden hinzugefügt, um die normale atomare Valenz auszufüllen. Methan wird daher einfach als "C".

Bei der Umwandlung in ein Molecule werden die Wasserstoffatome automatisch hinzugefügt.

Um eine lineare Kette von Atomen zu bilden, die durch Einfachbindungen verbunden sind, kombinieren Sie einfach ihre Symbole in der Reihenfolge.

Doppel- und Dreifachbindungen sind mit den Symbolen "=" und "#" und Ringe werden durch Hinzufügen einer numerischen Markierung zu zwei benachbarten Atomen bezeichnet.

Im Folgenden wird eine lineare Kette und eine Ringavariante dargestellt. Der einzige Unterschied in der Notation besteht darin, das erste und letzte Atom mit der gleichen Zahl zu markieren.

Verwandte Beispiele

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